科學施肥的原則：是有機和無機肥料相結合，重施底肥，配合施用種肥，適時合理追肥。

(1)增施有機肥

每公頃施用有機質含量百分之八以上的有機肥20噸以上，或純農家肥1噸以上，結合整地做底肥1次施入。

(2)平衡施用化肥

采用測土配方施肥技術，氮、磷、鉀合理搭配。一般每公頃施肥量按純氮18～36千克、五氧化二磷46～92千克、氧化鉀30～60千克，施用時折合成所用化肥的實際用量。同時增施中、微量元素肥料，每公頃施用硫酸鋅15～30千克;缺硫地塊還應增施硫肥，每公頃施用純硫30～60千克。

(3)采用科學的施肥方法

科學施肥法即分層施肥，也就是基肥深施，種肥淺施。分層施肥適宜的分配比例為底肥：氮、磷、鉀化肥總施用量的3/4，種肥：氮、磷、鉀化肥總施用量的1/4。具體方法如下：

a.種肥：氮、磷、鉀化肥總施用量的1/4量和部分中、微量元素肥料做種肥，施于種下3～5厘米。切忌種、肥同床，以免燒種。

b.底肥：氮、磷、鉀化肥總施用量的3/4量做底肥，施于種下8～12厘米。一般與有機肥一起結合秋翻整地一次施入。

c.追肥：包括根部追肥和根外追肥。

根部追肥：是指大豆開花結莢期，在土壤肥力較差的地塊，當底肥和種肥滿足不了大豆生長發育要求，大豆植株長勢較弱時，每公頃可追施尿素50～75千克，過磷酸鈣75～150千克。也可配合硫酸鉀，每公頃用量75千克左右。

根外追肥：也叫葉面噴肥。在土壤供給養分充足時，也可使用。在大豆開花始期或鼓粒初期，每公頃用5.0～7.5千克尿素和1.0～1.5千克磷酸二氫鉀對水500千克，葉面噴施。