提高肥料利用率。有機肥含有多種養分，但相對含量低，釋放慢，而化肥的單位養分含量高、成分少、釋放快。二者合理應用，相輔相成，有機質分解產生的有機酸也有促進土壤和化肥中礦物質養分的溶解。有機肥和化肥相互促進，有利于作物吸收和肥料利用率

改良土壤，培肥土壤，有機肥施入土壤后，有機質能改良土壤的理化狀況和生物特性，熟化土壤，增強土壤保持和提供肥料和緩沖的能力，并為作物的生長創造良好的土壤條件。

提高抗旱耐澇能力有機肥施入土壤后，可以增強土壤的蓄水保水能力。在干旱條件下，能提高作物的抗旱能力。施用有機肥后，還能改良土壤空隙，使土壤疏松，改良根系生態環境，可以促進根系的發育，提高作物的耐澇性。

增產提質，有機肥中有機質和各種營養元素，為農作物提供了營養，有機肥腐解后，為土壤微生物活動提供能量和養分，促進微生物活動，加速有機質分解。

減少環境污染，有機廢棄物中含有大量的病菌蟲卵，如不及時處理會傳播病菌，使地下水中氨態、硝態和可溶性有機氮濃度增加，地表和地下水富營養化造成環境質量惡化。因此，合理使用這些有機肥可以減少環境污染。